Depuis un mois, il est très à la mode de parler de la charge virale de SARSCoV2, souvent l’associer à des concepts pas tout à fait corrects.
Essayons ensemble de clarifier les différents ouvrages publiés par la Littérature scientifique.
Tout d'abord, ce qui est le téléchargement viral? Comment mesurer?
La charge virale se réfère à la concentration de virus présent ou dans le sang ou, comme dans le cas de SARSCoV2, sur le mucus.
En pratique clinique, à travers les tampons désormais célèbres, vous allez chercher des fragments de matériel génétique du virus et l’examen peut nous donner 3 Résultats: Négatif, faiblement positif, Positif.
Pour calculer la charge virale, vous devez utiliser des méthodes plus complexes qui, Pour l'instant, sont réservés exclusivement à la recherche.
Le matériel génétique est amplifié jusqu’à ce que la machine puisse détecter certains gènes viraux, plus de cycles d’amplification sont nécessaires pour les détecter et moins de virus étaient présents au début.
D’un point de vue scientifique, il est très important d’étudier la charge virale présente sur, aussi pour se faire une idée de la contagiosité des sujets: plus il y a de virus sur le mucus, c’est plus facilement que vous êtes contagieux
La charge virale est révélatrice de la contagiosité?
Il s’agit d’un apport raisonnable valable pour d’autres maladies infectieuses, mais difficile à prouver.
Des chercheurs canadiens l’ont essayé en publiant leurs travaux en mai sur les maladies infectieuses cliniques(1).
Leur idée était: si je peux développer le virus in vitro à partir du tampon, cela signifie que le virus est vital, potentiellement infecter.
La culture virale, contrairement à la culture bactérienne, est beaucoup plus complexe et des échecs sont attendus même en présence de virus abondants et vitaux.
En commençant par 90 tamponi positivi sono riusciti a coltivare il virus dans 26 cas. La cosa interessante è che è stata notata una correlazione significativa tra la carica virale e la probabilità di avere una coltura positiva.
« La régression logistique multivariée utilisant la culture positive comme variable prédictrice (résultat binaire) et STT, l’âge et le sexe en tant que variables indépendantes ont montré Ct comme étant significative (Ou 0.64 95% Il 0.49-0.84, p<0.001). Cela implique que pour chaque augmentation unitaire de Ct, les chances d’une culture positive ont diminué de 32 %.>< 0.001) Cela implique que pour chaque augmentation unitaire de Ct, les chances d’une culture positive ont diminué de 32 %. (pour les cycles de réplication inférieurs, une charge virale plus élevée est prévue)
Quelle est la charge virale de l’asymptomatique?
Le 19 Février, Au moins 2 jours avant qu’un Italien puisse se vanter d’être un expert sur COVID, une lettre a été publiée aux éditeurs dans le New England Journal of Medicine(2), dans lequel un groupe de chercheurs chinois a décrit la charge virale de 17 sujets infectés et a conclu:
« a charge virale qui a été détectée dans le patient asymptomatique était similaire à celle des patients symptomatiques, qui suggère le potentiel de transmission des patients asymptomatiques ou minimalement symptomatiques »
Oui, vous avez bien fait les choses, Lla 19 les médecins chinois ont averti le monde que les patients asymptomatiques présentant peu de symptômes pourraient avoir une charge virale sur les muqueuses semblables à symptomatiques et qu’ils pourraient donc être tout aussi contagieux.
Message très clair, publié gratuitement sur 19 février dans l’une des revues scientifiques les plus prestigieuses.
C’était une lettre aux éditeurs, pas une vraie étude. À prendre en compte mais toujours avec un doute raisonnable.
Début avril, les résultats des études du groupe du Professeur Crisanti sur la gestion de l’épidémie de Vo' Euganeo sont diffusés.
Dans leur travail, le 42,5% d’asymptomatique.
La charge virale de 23 sujets asymptomatiques, 3 sujets pré-symptomatiques (en incubation) et de 30 sujets symptomatiques.
Leurs conclusions ont été:
« ous n’avons trouvé aucune différence statistiquement significative dans la charge virale des infections symptomatiques par rapport aux infections asymptomatiques ».
Une autre confirmation dure à digérer. En avril, c’était « ust » un article pré-imprimé, non examiné par la communauté scientifique, potentiellement plein d’erreurs. Malheureusement pour l’épidémie, heureusement pour la science, erreurs qu’ils n’ont pas trouvé et après 2 mois d’examen a été publié aujourd’hui, 30 Juin, sur un autre magazine très important: Nature, 19 ans(3).
Il ne suffit pas, Lla 18 « par rapport à ceux qui ont une faible charge virale(4) un autre article écrit par des collègues chinois dans lequel ils ont été évalués 37 patients asymptomatiques et 37 Symptomatique.
Leurs résultats confirment ce qui a été:
« Les valeurs Ct initiales pour 37 individus asymptomatiques et 37 patients symptomatiques semblaient similaires »
Il décrit également un temps plus long pour éliminer le virus dans l’asymptomatique que les. Un autre coup agréable pour ceux qui essaient de contrôler cette épidémie.
Il semble que les asymptomatiques ont la même charge virale que les symptomatiques, mais qu’elle dure plus longtemps.
Jusqu’à présent, des patients symptomatiques mais non graves ont été évalués.
Quelle est la charge virale sous des formes sévères?
Ici, le discours change. Le 19/3 une lettre est publiée aux rédacteurs de Lancet Infectious Disease(5) qui décrit la charge virale de 46 patients symptomatiques atteints de 30 avec des formes sévères.
« Les patients atteints de COVIDE-19 sévère ont tendance à avoir une charge virale élevée et une longue période d’excrétion de virus. »
Les formes si graves ont une plus grande charge virale et qui dure plus longtemps.
Une étude sur 92 Patients(6) a décrit une charge virale plus importante sous des formes graves que les:
« es patients graves avaient des valeurs de Ct significativement inférieures à celles des cas modérés à l’admission » (un faible nombre de cycles de réplication, Ct, suggère une charge virale élevée)
Une autre étude plus systématique, menée le 308 patients hospitalisés(7) une charge virale significativement plus élevée chez les patients critiques que les autres patients:
« Les patients critiques avaient les charges virales les plus élevées, contrairement aux patients généraux affichant les charges virales les plus faibles »
Venez cambia la carica virale nel tempo?
Su questo punto sembra esserci un andamento simile tra le varie forme di malattia (Symptomatique, Asymptomatiques, forme intermedie e gravi): la carica virale è massima all’inizio e decade con il tempo (3,5,7).
« ous constatons que la charge virale a tendance à culminer autour du jour de l’apparition des symptômes et pour la plupart des sujets a tendance à diminuer après l’apparition des symptômes (Vo')” (3)
Une autre donnée intéressante peut être obtenue en évaluant la tendance de la charge virale chez les patients qui ont ou n’ont pas développé d’immunoglobulines(8).
Les immunoglobulines sont produites après 7-10 jours de contagion et représentent une réponse de notre système immunitaire.
Les chercheurs ont souligné qu’il y a une baisse progressive de la charge virale chez les patients non graves où les immunoglobulines sont présentes tandis que chez les patients qui n’ont pas encore développé d’immunoglobulines, la charge virale continue de croître..
« Parmi les patients positifs d’IgM, les charges virales ont montré des tendances différentes parmi les cas avec une gravité différente, tandis que les charges virales des patients igm-négatifs ont eu tendance à augmenter avec le temps après le début.
La charge virale est un indice de gravité de la maladie?
Nous avons vu que les formes les plus graves ont une charge virale plus élevée, il est également raisonnable de se demander si une charge virale plus élevée sur les débuts correspond à un cours pire.
Dès le mois d’avril, nos collègues chinois(6) décrit que les patients présentant des charges virales à début plus élevé ont développé une maladie plus grave.
« es patients ayant une charge virale de base plus élevée sont plus susceptibles de devenir grave ».
Une étude très complète vient d’être publiée, menée par des collègues à New York(9): charge virale a été vérifiée sur le début de bien 678 patients hospitalisés 2 grands hôpitaux dans la Grosse Pomme.
Ils ont divisé les tampons en 3 groupes basés sur la charge virale et ont évalué la probabilité d’être intubé et la mortalité.
« ans un modèle multivarié [...], une charge virale élevée était associée indépendamment à un risque accru de mortalité à l’hôpital (rapport de cotes ajustés [Aor] 6.05; 95% Il: 2.92-12.52; P<0.001) par rapport à avoir une faible charge virale »
« par rapport à ceux qui ont une faible charge virale, une charge virale élevée a également été associée indépendamment à un risque accru d’intubation (Aor 2.73; 95% Il: 1.68-4.44; P<0.001)”
Ainsi, ceux qui ont une faible charge virale sont moins susceptibles d’être intubés et de mourir.
J’ai trouvé cet article très intéressé et il semble correct de passer quelques mots de plus sur certaines données qui émergent.
« e la 49 patients qui ont subi un test positif au SRAS-CoV-2, mais qui ont reçu leur congé de l’ED et qui n’ont pas été admis, la valeur médiane de Ct était de 29,1 » (Et: Service d'urgence)
Le 49 patients libérés de la salle d’urgence (donc probablement avec des formes douces) ils avaient une charge virale moyenne qui est tombé dans la classe moyenne.
Une autre considération importante: De 727 (678 + 49) patients qui ont un écouvillon dans la salle d’urgence uniquement sur 7% il a été libéré.
New York a connu le même drame que tant de grands hôpitaux en Lombardie: qui pourrait se rendre à l’hôpital, c’est parce qu’il avait besoin d’un lit.
La mortalité globale avait également des données similaires à notre:
« 19,2% des patients étaient morts lors de leur admission »
Excusez l’excursus, revenons au sujet.
Alors, passons à la question fatidique: la charge virale en Italie a changé?
Le 29/5 a été envoyé à la revue Clinical Chemistry and Laboratory Medicine les travaux du groupe san Raffaele à Milan(10), pas encore publié, mais déjà évalué par les pairs et accepté 4/6 (disponible sur Reserchgate)
Dans ce travail, ils ont été évalués 100 écouvillons fabriqués entre 7 et 10 Avril et 100 écouvillons fabriqués entre 12 et 19 Mai.
Les groupes étaient homogènes en ce qui concerne le sexe, l’âge et le pourcentage de patients hospitalisés (12 Vs 14%).
Les tampons fabriqués en mai avaient une charge virale nettement inférieure à celles fabriquées en avril.
D’après les autres articles, nous avons vu que les principaux facteurs influençant la charge virale moyenne d’un groupe de sujets sont la part des patients graves et la distance entre les symptômes/la contagion et l’écouvillon.
Malheureusement, ces données n’ont pas été explicites dans l’étude et, à mon avis, ne permet pas une analyse complète, surtout compte tenu de la façon dont l’utilisation des tampons en Italie a changé dans l’épidémie: en mars en Lombardie tampons ont été faites presque exclusivement aux patients pour lesquels l’hospitalisation a été évaluée, maintenant l’utilisation extensive des tampons est faite et de nombreux asymptomatiques émergent. En outre, depuis le mois de mai, une utilisation massive de la sérologique a été faite à partir de sujets mis en quarantaine et, mettant en évidence de nombreux points positifs étudiés avec tampon, dont la positivité était indicative d’une infection d’au moins 7-10 jours.
Conclusions:
-la charge virale est un indice de contagiosité
-asymptomatique ont une charge virale similaire à des symptômes non graves.
-sous des formes graves, une charge virale significativement plus élevée est observée
-la charge virale est maximale dans les premiers jours et se décompose avec le temps, en particulier chez les patients atteints d’Ig
-l’apparition de charges virales élevées sont caractérisées par un pronostic plus
Nb
-En termes médicaux asymptomatiques sont les personnes infectées qui n’ont jamais de symptômes.
-La charge virale et la charge infectieuse sont 2 différents concepts: la charge virale est la quantité de virus présente sur les muqueuses, J’ai parlé dans ce post; la charge infectieuse est la quantité de virus avec lequel un sujet est infecté. Il n’a pas encore été précisé si une faible charge infectieuse correspond vraiment à une condition mineure, c’est possible, mais il n’a pas encore été prouvé et de toute façon il n’est pas certain.
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2. Zou L, Ruan F, Huang M, Liang L, Huang H, Hong Z, et al. Charge virale SRAS-CoV-2 dans les échantillons respiratoires supérieurs de patients infectés [Internet]. Vol. 382, New England Journal of Medicine. Massachussetts Medical Society; 2020 [Cité 2020 Avr 22]. p. 1177–9. Disponible à partir de: http://www.nejm.org/doi/10.1056/NEJMc2001737
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3. Lavezzo E, Franchin E, Ciavarella C, Cuomo-Dannenburg G, Barzon L, Del Vecchio C, et al. Suppression d’une épidémie de SRAS-CoV-2 dans la municipalité italienne de Vo'. Nature, 19 ans [Internet]. 2020 Jun 30; Disponible à partir de: http://www.nature.com/articles/s41586-020-2488-1
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4. Long Q-X, Tang X-J, Shi Q-L, Li Q, Deng H-J, Yuan J, et al. Évaluation clinique et immunologique des infections asymptomatiques du SRAS-CoV-2. Nat Med [Internet]. 2020 Jun 18; Disponible à partir de: http://www.nature.com/articles/s41591-020-0965-6
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